从历史上看，子域名和子目录几乎是同一时间开始使用的。顺便提示一下，你可以从这个例子：subdomain.example.com/subdirectory/ 看出子域名和子目录的概念。其中子域名是“subdomain”，子目录是“subdirectory”。如果你还不清楚，你可以阅读一下我的文章：关于URL组成部分的指南。
（夫唯：以下内容是在不改变原文意思的基础上分点描述，以更条理，方便阅读和理解）
子域名和子目录：
通常，一个子域名是一个域名系统（DNS）的别名，或者叫二级域名。对于不是很熟悉 “CNAME”概念的网络管理员新手来讲，子域名的设置可能有点难度。子域名可以分开管理：
这对你来说也许是个好事：如果你想转移你网站的一部分，你可以使用DNS来和子域名脱钩。
但也可能是个头疼的事：DNS的设置相当麻烦，不像使用子目录一样仅仅使用几个命令就可以建立或移动子目录。
如果你把你的内容放在子目录里，通常的原则是所有内容和代码都存放在同一空间里。这可以使查找/编辑/更改代码变得很容易。同时，把代码从一个地方移到另一个地方也比较容易。
以我为例，当我开始建我的博客时，我决定用一个子目录（mattcutts.com/blog/），仅仅是想使事情变得简单。
几年来，Google 使用了一个所谓“密集主机（host crowding）”的算法，指的是：对一个域名的每个主机名（hostname）或子域名，Google 最多显示两个结果。
从一个子域名内显示1-2个结果，这种办法一直运行非常好，但也有网友向我们提出这样的投诉：对某些类型的关键词（如生僻关键词、关键词短句或长尾关键词等），Google 的搜索页面上可能出现很多结果都来自同一个域名。在过去几个星期里，我们改变了我们的算法，使这一现象不太可能再发生。
但这一变化并不会彻底改变有些搜索结果全部来自同一域名的情况。如果某个域名相关性确实非常强，我们仍可能从那个域名中返回多个结果。举例来讲，如果一个用户搜索[ibm]，用户可能确实喜欢并想看到从 ibm.com 的结果。注意：我们的算法变化是一个相当微妙的过程，并没有影响到我们绝大部分的搜索结果。
对子域名和子目录，我个人更喜欢子目录。这是因为子目录为我的大部分内容提供了方便。一个子域名可有效分离出完全不同的内容。例如，Google为完全不同的产品使用子域名，例如 news.google.com 或 maps.google.com。如果你是一个网络管理员或 SEO 新手， 我建议你使用子目录，直到你对你的网站结构有足够的信心。在这一点上，您将可以对你的网站有更好的理解，从而作出正确的决定。